Робота присвячена вивченню екології вільноживучих війчастих найпростіших (Chromista, Ciliophora) в умовах континентальних водойм України. Проаналізовано дані про їх поширення у основних річкових басейнах України. Згідно з узагальненими даними, фауна інфузорій України представлена 1192 видами, що належать до 303 родів, 128 родин і 38 рядів з 11 класів. Запропоновано методологію виділення ценотичних структур вільноживучих війчастих найпростіших на основі розподілу їх популяцій у факторних градієнтах. Показано, що у гіперпросторі водойм формуються специфічні ценотичні структури з власною системою координат, незалежною від просторових координат традиційних біотопів - бенталі, перифіталі, пелагіалі. Запропоновано поняття "біотопічного парадоксу", згідно з яким найпростіші формують у фізичному просторі біотопів специфічні ценотичні об'єднання, згідно зі скалярними полями фізичних і хімічних факторів. Показано, що у межах кожного з біотопів (бенталі, пелагіалі, перифіталі) може локалізуватись кілька ценотичних об'єднань найпростіших, що мають різні структурні характеристики - видовий склад, чисельність і біомасу. Виділені два найбільш інтегровані структурно і функціонуючі на різних біохімічних платформах ценотичні об'єднання - аеробне і анаеробне угруповання. Запропоновано універсальну одиницю виміру щільності популяцій війчастих найпростіших, яка дозволяє коректно розраховувати і порівнювати структурні та енергетичні показники угруповань найпростіших в бенталі, перефіталі та пелагіалі. Запропоновано алгоритм розрахунку інтенсивності деструкції анаеробними інфузоріями, що дозволило оцінити їхній вклад у загальну деструкцію у водоймі. Проаналізовано зміни структури населення вільноживучих війчастих найпростіших в гідроекосистемах з різним рівнем трофності. На основі виділених ценотичних структур запропоновано метод ценоіндикації. Метод дає можливість здійснювати експрес-оцінку стану водойми на основі визначення типу і кількості присутніх у водоймі ценоекоморф.